• Le 07 octobre 2019

« Mise en place d’une interface graphique assistée d’analyses non supervisées de données de cytométrie en flux avec le package FlowSOM »


Laure-Agnès CHEPEAUX, stagiaire en Master 2 Bioinformatique sur la PF Cytocell
Elle a travaillé sur la mise en place d’une interface web intuitive et simple d’utilisation, ayant pour but d'effectuer l’analyse non supervisée de jeux de données de cytométrie en flux, acquis au préalable de manière standardisée. Ce pipeline permet la prise en charge de l’ensemble des fichiers FCS, de leur pré-traitement automatisé (compensation, transformation, gestion des artefacts etc. ) à l’analyse via le module FlowSOM jusqu’à la génération de fichiers fcs complémentés des coordonnées d’arbres FlowSOM, permettant ainsi de les analyser avec des logiciels classiques de cytométrie (DiVa, FlowJo).