Plateforme MicroPICell


La plate forme MicroPICell propose une offre intégrée complète en imagerie cellulaire et tissulaire. Un point d'entrée centralisé par un système de réservation et facturation unique pour l'ensemble des prestations proposées permet aux utilisateurs et collaborateurs d'avoir accès aux services de préparation des échantillons, d'observation en microscopie photonique et de gestion et analyse des données images générées.

Elle regroupe des équipements en histologie et en bio-imagerie et possède les compétences scientifiques et techniques pour tous vos projets scientifiques en sciences du vivant.

Les acteurs de la plateforme mettent au point de nouveaux protocoles en accord avec les utilisateurs du service. Ainsi, les scientifiques ligériens peuvent s'appuyer sur les compétences des responsables de la plateforme pour élaborer de nouvelles études innovantes.

Les responsables de la plateforme s'investissent fortement dans la formation à la bio-imagerie. Cette discipline connait actuellement une évolution technologique majeure, de ce fait la formation à cette science devient un enjeu fondamental.

La plateforme est une structure ouverte à tous les personnels appartenant aux unités constituantes de la SFR Bonamy mais également aux unités de recherche extérieures à la structure fédérative de recherche et aux entreprises privées.


Savoir-faire

Le service d’histologie dispose des matériels nécessaires à la préparation des échantillons, des automates pour le traite ment des lames et des matériels d'imagerie pour l'analyse des résultats.
  • Techniques histologiques (colorations, immunomarquages et multiplexing)
  • Tissue micro array
  • Scanner de lames. (Création de lames virtuelles)

Le service d’imagerie est équipé de microscopes à fluorescences (super résolution, confocaux et champ-larges) adaptés à l'acquisition de données en système vivant ou fixé

  • Visualisation et quantification de fluorescence sur cellules et tissus
  • Mesures intracellulaire de flux ioniques
  • Mesures de dynamiques moléculaires
  • Criblage à haut débit (HCS)
  • Microscopie de super résolution
  • Imagerie d'échantillons épais (par exemple organoïdes)

Le service de traitement et analyse des données images forme et assiste les biologistes dans l’utilisation des outils d’analyse d’images et développe des outils spécifiques (algorithmes) de traitement des données.

  • Dynamiques moléculaires/cellulaires, simulation, calcul et modélisation
  • Normalisation de cellules
  • Recalage d’images (imagerie corrélative)
  • Tracking cellulaire

Equipements

Applications

L'expertise et les équipements de la plateforme lui permettent de collaborer dans le cadre d'études en cancérologie, pathologie, immunologie, physiologie, toxicologie, sciences des matériaux.
Mis à jour le 16 janvier 2024.
https://sfrsante.univ-nantes.fr/fr/plateformes/plateforme-micropicell