Ludovic Leconte intègre la plateforme MicroPICell en tant que responsable scientifique adjoint

Opticien de formation, Ludovic Leconte a initialement travaillé dans le domaine des lasers et de la fibre optique, notamment en astrophysique au laboratoire LULI (CNRS, école polytechnique, CEA, Sorbonne Université). A partir de 2011, il s’est tourné vers la microscopie sur diverses plateformes en France et à l’étranger. Il intègre d'abord la plateforme Bioemergence (CNRS, Université Paris Cité) située à Gif-sur-Yvette et dirigée par Nadine Peyrieras. Pendant 2 ans, il a développé ses expertises sur les premiers modèles de Light Sheet ainsi qu’en microscopie biphotonique pour travailler sur des modèles marins (zebrafish,oursins…).
En 2013, il rejoint l’Institut Curie pendant 10 ans et a obtenu son poste CNRS en 2014. Pendant cette période, il a travaillé sur la plateforme Nikon Imaging Center et œuvré à de nombreux développements sur la microscopie à feuille de lumière (SPIm et Lattice Light Sheet) et d’autres techniques en Super Résolution. Il s’est notamment spécialisé sur les mitochondries et la voie endosomale. En partenariat avec l’Inria de Rennes ; il a contribué à la mise en place de programmes de machine learning et d’autres outils en data management avec BioImageIt et en débruitage/déconvolution.

En 2023, il part aux Etats-Unis pour concevoir et assembler divers systèmes de microscopie. Pour les plus experts il s’agissait du Tirf Azimuthale muti angles, OSpim ou encore le Line Scan (confocal).
Poussé par ses envies de découvrir de nouveaux systèmes de microscopie, et aussi une autre langue et culture, il part en Uruguay fin 2024 sur une plateforme de l’Institut Pasteur (Advanced Bioimaging Unit).  Son objectif : mettre ses expertises au service d’une conception optique d’un microscope 2 photons et de la programmation. Il a développé le SPAD (Single-Photon Avalanche Diode) Array en Biphoton pour faire du FLIM (Fluorescence-lifetime imaging microscopy). Cette technique présente l’avantage d’imager des échantillons à une profondeur plus importante, avec une meilleure résolution, sensibilité et en réduisant la phototoxicité. (en savoir plus)

Il a aussi dispensé des formations sur FIJI et Napari et aider les utilisateurs en analyses d’images.

Désormais arrivé sur la plateforme, sans transition depuis l’Uruguay et avec un delta de 30°C, Ludovic vous proposera ses expertises techniques sur les divers systèmes de microscopie confocale et surtout LightSheet. Il sera aussi en charge des analyses d’images et du data management. De plus, il développera des outils de simplification de l’analyse d’images ainsi que des collaborations au niveau régional et national. Et bien sûr, une fois qu’il se sera bien acclimaté aux systèmes existants sur la plateforme, il garde dans un coin de tête la possibilité de développer et concevoir de nouvelles technologies de microscopie.
 

Je suis heureux de revenir en France, sur une plateforme composée de très bons équipements et de collègues dotés d’expertises très pointues. Aux côtés de Steven, je vous proposerai mes compétences complémentaires : l’analyse d’image et le data management, la microscopie confocale et à feuilles de lumière et à plus long terme des développements technologiques pour répondre à vos besoins.

Ludovic prend la responsabilité scientifique adjointe en tuilage avec Perrine Paul-Gilloteaux et aux côtés de Vincent Guen (responsable scientifique).
En effet, Perrine a rejoint le LS2N (Laboratoire des sciences du numérique de Nantes) pour développer les applications biologiques autour du recalage et de la fusion de données, de l'analyse de données spatiales omics et de l'adaptation des méthodes aux très gros fichiers.
Elle gardera néanmoins une activité sur BioCore et MicroPICell un jour par semaine jusqu'au 31/12/2026.

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