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Un nouveau Séquenceur sur la plateforme GenoA : le NovaSeq X plus d’Illumina

https://sfrsante.univ-nantes.fr/medias/photo/sequenceur_1765211537961
  • Le 10 décembre 2025
    IRS-UN
    8 quai Moncousu à Nantes
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Jusqu’à 5 000 échantillons sont séquencés annuellement sur GenoA. Dès 2026, sur la base de nouveaux partenariats nationaux et européens, plus de 1 500 génomes humains supplémentaires seront séquencés chaque année. Pour accompagner cette forte croissance, GenoA s’est équipée cette année d’un séquenceur plus performant. Ce séquenceur dernière génération, à très haut-débit permet de traiter jusqu’à 2,5 fois plus d’échantillons d’ADN/ARN simultanément, améliorant ainsi la rapidité de traitement et la diminution des coûts jusqu’à 50% pour certaines applications.

Une grande diversité d’analyses peut être réalisée, notamment : séquenceur novaseq X illumina
  • l’analyse de génomes complets
  • le génotypage par séquençage
  • l’analyse du transcriptome
  • l’analyse en cellules uniques
  • les analyses épigénétiques
  • l’analyse du microbiote

Il existe trois supports de séquençage (Flow cell) permettant d’adapter le séquençage au dimensionnement du projet : de 1.5 à 25 milliards de reads (lectures) produits ce qui représente 500 Gbases à 8 Tbases produites en sortie de run.

Le séquenceur a été acquis par Nantes Université grâce au financement CPER Phenomics porté par la SFR Bonamy et au soutien du CHU de Nantes pour un montant total de plus d’un million d’euros.

Cette acquisition a permis à GenoA de se positionner dans des projets nationaux et européens (horizon Europe, ANR-PEPR, AXA fondation, RHU).

L’analyse des données est facilitée par les liens étroits avec la plateforme de bio-informatique BiRD et le mésocentre GLiCID. BiRD a investi dans un serveur de calcul basé sur une puce reprogrammable (FPGA). Ce type d'équipement offre une solution ultra-performante, rapide, et modulable pour l'analyse des génomes entiers. Il permet un traitement des données jusqu'à 20 à 50 fois plus rapide que les analyses classiques basés sur CPU

L’inauguration aura lieu ce 10 décembre à l’IRS-UN à Nantes en présence de :
 
  • Olivier Grasset - Vice-Président recherche Nantes Université,
  • Philippe El Saïr - Directeur Général du CHU de Nantes,
  • Pierre-Louis Tharaux - DR Inserm, Directeur Adj de l’institut de Physiologie, Métabolisme et Nutrition,
  • Franckie Trichet - Vice-Président Innovation-Numérique Nantes Métropole.

                     

Tutelles : 
                                                                                             
Mis à jour le 08 décembre 2025.