Séquenceur haut débit

OPERATION 2 - CRIBLAGE HAUT DEBIT

Le séquenceur haut-débit acquit génère plus de 1 000 Gb de données par cycle d’utilisation, pour une durée de cycle maximale de 5 jours. Son acquisition permet la réalisation de cycles de séquençage de débit moindre (< 500 Gb) pour une durée de cycle inférieure à 3 jours, afin de garantir une flexibilité d’utilisation. Il permet également une grande diversité d’applications : le séquençage de génomes eucaryotes complets, de régions chromosomiques ciblées, d’ARN, de régions méthylées, et l’analyse du microbiote.

Localisation Plateforme GenoA

Contexte
TRANSLAT NANTES 2015-2020 - Recherche translationnelle en Santé

La SFR Bonamy pilote pour le site santé nantais l'achat des équipements lourds mutualisés. Elle a assuré en 2014 la responsabilité du montage du dossier scientifique CPER Translat pour la communauté biomédicale nantaise. En collaboration très étroite avec tous les directeurs des laboratoires de recherche du site nantais et les responsables scientifiques des plateformes mutualisées, la SFR a défini les objectifs et les priorités technologiques inscrits dans le CPER.

Les contrats de plan État-Région (CPER) constituent un outil de développement entre l’État et les régions, par la mise en œuvre de projets structurants. Les CPER viennent renforcer la politique d’aménagement au service de l’égalité des territoires. TRANSLAT Nantes 2015-2020 est une opération CPER qui s’est déployée sur le site nantais en biologie santé.

TRANSLAT Nantes a permis d’acquérir des équipements pour plusieurs plateformes technologiques de la SFR Bonamy.

Ces équipements ont pour but de renforcer les interfaces entre les champs de recherche fondamentale, translationnelle, technologique et clinique ; de consolider le continuum vers la valorisation économique et sociétale ; de maintenir des moyens équilibrés, matériels et humains, entre recherche fondamentale et finalisée en santé et de promouvoir la multidisciplinarité.

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