Plateforme MicroPICell
La plateforme MicroPICell propose une offre intégrée complète en imagerie cellulaire et tissulaire. Un point d'entrée centralisé par un système de réservation et facturation unique pour l'ensemble des prestations proposées permet aux utilisateurs et collaborateurs d'avoir accès aux services de préparation des échantillons, d'observation en microscopie photonique et de gestion et analyse des données images générées.
Elle regroupe des équipements en histologie et en bio-imagerie et possède les compétences scientifiques et techniques pour tous vos projets scientifiques en sciences du vivant.
Les acteurs de la plateforme mettent au point de nouveaux protocoles en accord avec les utilisateurs du service. Ainsi, les scientifiques ligériens peuvent s'appuyer sur les compétences des responsables de la plateforme pour élaborer de nouvelles études innovantes.
Les responsables de la plateforme s'investissent fortement dans la formation à la bio-imagerie. Cette discipline connait actuellement une évolution technologique majeure, de ce fait la formation à cette science devient un enjeu fondamental.
La plateforme est une structure ouverte à tous les personnels appartenant aux unités constituantes de la SFR Bonamy mais également aux unités de recherche extérieures à la structure fédérative de recherche et aux entreprises privées.
Savoir-faire
ment des lames et des matériels d'imagerie pour l'analyse des résultats.
- Techniques histologiques (colorations, immunomarquages et multiplexing)
- Tissue micro array
- Scanner de lames. (Création de lames virtuelles)
Le service d’imagerie est équipé de microscopes à fluorescences (super résolution, confocaux et champ-larges) adaptés à l'acquisition de données en système vivant ou fixé
- Visualisation et quantification de fluorescence sur cellules et tissus
- Mesures intracellulaire de flux ioniques
- Mesures de dynamiques moléculaires
- Criblage à haut débit (HCS)
- Microscopie de super résolution
- Imagerie d'échantillons épais (par exemple organoïdes)
Le service de traitement et analyse des données images forme et assiste les biologistes dans l’utilisation des outils d’analyse d’images et développe des outils spécifiques (algorithmes) de traitement des données.
- Dynamiques moléculaires/cellulaires, simulation, calcul et modélisation
- Normalisation de cellules
- Recalage d’images (imagerie corrélative)
- Tracking cellulaire
Equipements
Applications
English version
Coordonnées
Contacts
Vincent Guen, responsable scientifique adjoint
Steven Nedellec, responsable technique
Imagerie photonique
Philippe Hulin
Aurélie Joussaume
Steven Nedellec
Histologie, préparation des échantillons
Stéphanie Blandin
Philippe Labrot
Yevgeniya Simon
Missions transverses
Aurélie Doméné (projet CODEX/phenocycler)
Anne Gaignerie (organoïdes)
Analyse d'images
Mélodie Ambroset
Perrine Paul-Gilloteaux
Mission France Bioimaging FBI DATA
Théo Barnouin
Marc Mongy
En savoir plus
Labels et certifications
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