PFSM

La plate-forme de spectrométrie de masse (PFSM) est une structure issue du Centre de Recherche en Nutrition Humaine Ouest (CRNH-Ouest), un groupement d'intérêt public qui fédère les unités de recherche de l’Ouest de la France autour d’une thématique commune : la nutrition humaine et la prévention des maladies métaboliques (obésité, diabète, cholestérolémie). Le CRNH-Ouest comprend actuellement plus de 200 chercheurs équivalent temps plein qui travaillent en synergie sur les thèmes suivants : la nutrition néonatale, le système nerveux entérique et sa relation avec le système nerveux central, les allergies alimentaires, et les lipides alimentaires et les pathologies chroniques.

Le CRNH-Ouest s'appuie sur les équipes des unités de recherche INRAE, Inserm, Oniris, et universitaires (Université de Nantes) et des services hospitaliers (CHU Nantes). Il s’appuie également sur des plates-formes de recherche et de service, comme la PFSM, qui est aussi rattachée à la structure CORSAIRE de Biogenouest.

Nos travaux portent principalement sur les maladies métaboliques et les risques cardiovasculaires associés, par l'exploration ciblée ou non (in vivo et in vitro) des composants des lipoprotéines humaines et animales. La PFSM s'intéresse également à la mesure des flux métaboliques et lipoprotéiques via l'utilisation de traceurs enrichis en isotopes stables.

Savoir-faire

La PFSM propose divers types d'analyses dans tous types de matrices biologiques (in vivo, in vitro, animales et humaines).

Nous travaillons régulièrement sur les matrices suivantes :

  • Sérum, plasma
  • Tissus
  • Urines
  • Lait maternel
  • Selles
  • Cellules

Et réalisons des analyses de type :

  • Analyses non ciblées (lipidomique, métabolomique)
  • Analyses quantitatives ciblées (lipides et apolipoprotéines, acides aminés et protéines, acides organiques, sphingolipides permettant d’approcher la résistance à l’insuline, méthylamines et acides gras à chaine courte permettant d’approcher le microbiote intestinal , xénobiotiques...)
  • Analyses cinétiques dans des protocoles impliquant l'utilisation de traceurs enrichis en isotopes stables (fluxomique protéines et métabolites)
  • Analyses structurales et élémentaires (mesure de masses exactes)

Equipements

La PFSM est dotée des équipements suivants :
  • GC-EI/CI-MS
  • GC-C-EI-IRMS
  • UPLC-ESI-MS/MS (QqQ)
  • UPC²-ESI-MS/MS (QqQ)
  • UPLC-ESI-HRMS (Q-TOF)
  • Ultracentrifugeuse